نم صدور الأمر الكريم باستقلال 3 جامعات وهم (جامعة الملك سعود، جامعة الملك عبدالعزيز، جامعة الإمام عبدالرحمن بن فيصل) كما ان نظام الجامعات الجديد، عقب صدر مرسوم ملكي بالموافقة على النظام الذي أقره مجلس الوزراء، العام الماضي، قبل بدء تطبيق النظام على «3 جامعات»، كمرحلة أولى ونص المرسوم على أن يحدد مجلس شؤون الجامعات 3 جامعات مرحلة أولى على الأكثر لُيطبَّق عليها النظام بعد نفاذه
ومن ثم يُطبق على الجامعات الأخرى تدريجيًا بأمر من رئيس مجلس الوزراء بناء على اقتراح من مجلس شؤون الجامعات ويرفع مجلس الوزراء إلى المقام السامي تقريرًا كل عامين عن نتائج تطبيق النظام وما يتضمنه من إيجابيات أو صعوبات، أو غيرها إن وجدت، على أن يستمر تطبيق الأنظمة واللوائح المعمول بها، حاليًا، بما فيها نظام مجلس التعليم العالي والجامعات الصادر عام 1414 على الجامعات غير المشمولة بتطبيق النظام إلى حين شمولها به.
كما ان تم نص نظام الجامعات الجديد أيضًا على منح الجامعات، التي سيطبق عليها النظام، مدة انتقالية عام من تاريخ نفاذ النظام بحيث يستمر خلالها العمل باللوائح الجامعية الحالية إلى أن يُصدر مجلس شؤون الجامعات اللوائح المالية والإدارية والأكاديمية للجامعات، لتتوافق مع أحكام النظام، وبما لا يخل بسلطة مجالس الأمناء في الإشراف على الجامعات، ولمجلس شؤون الجامعات زيادة المدة الانتقالية لتلك الجامعات أو بعضها على ألا يتجاوز التمديد 3اعوام من تاريخ انتهاء المدة الانتقالية المحددة بعام واحد
كما ان أكد نظام الجامعات الجديد استمرارية موظفي الجامعات التي سيطبق عليها النظام بمن فيهم أعضاء هيئة التدريس ومن في حكمهم والإداريون، والفنيون، الذين هم على رأس العمل وقت نفاذ النظام على أنظمتهم الوظيفية التي يخضعون لها. ويقترح مجلس شؤون الجامعات الخيارات والترتيبات اللازمة لمعاملتهم بما فيها تحويلهم إلى نظام العمل، وبما لا يؤثر على حقوقهم المالية المكتسبة، ويرفع بذلك لإكمال اللازم في شأنه وتضمنت لائحة نظام الجامعة 58 مادة مختلفة، نصت إحداها على حق الجامعة في تقاضى مقابل مالي لتنمية إيراداتها الذاتية، كفرض رسوم دراسية لبرامج الدراسات العليا وبرامج الدبلومات والدورات التعليمية والتدريبية ورسوم من الطلبة غير السعوديين كما ان يستثنى من ذلك المنح الدراسية المجانية ومبالغ مالية مقابل القيام ببحوث علمية أو خدمات استشارية لجهات أخرى داخلية أو خارجية بما لا يخل بأهداف الجامعة ورسالتها
